Hasta el siglo X no adquirió cierta importancia, cuando se convirtió en un centro comercial para los condes de Tolosa.

Médicos judíos crearon la Escuela de Medicina a principios del siglo XIII.

Durante el siglo XIX, la ciudad se desarrolló industrialmente convirtiéndose en un importante centro de la región.

Montpellier tiene 106 edificios clasificados o inscritos como monumento histórico (el 19 % de los edificios históricos del departamento), siendo los principales: Y construida en época reciente, el área de Antigone, un espacio público obra del arquitecto español Ricardo Bofill y ejecutado por Ricardo Bofill Taller de Arquitectura.

La universidad fue fundada en 1220 por el cardenal Conrad y confirmada por el papa Nicolás IV en una bula en 1289.