En 1956 se crea la Universidad Nacional del Nordeste (UNNE), como centro universitario para las provincias de Chaco, Corrientes, Misiones y Formosa.

La actividad en Formosa comenzaría luego a partir de un convenio entre la UNNE y el gobierno provincial.

Allí comienzan a funcionar los primeros profesorados y la carrera de Ingeniería Forestal (1973).

[2]​ Se transfieren a la nueva universidad las sedes de la UNNE en Formosa.

El último rector normalizador, el Profesor Roberto Juan Acosta, permaneció por dos años y ocho meses.

En 2002 la Asamblea Universitaria es convocada por segunda vez para la elección de rector y vicerrector.