UniFrac

UniFrac es una métrica de distancia utilizada para comparar comunidades biológicas.

Tanto las variantes ponderadas (cuantitativas) como las no ponderadas (cualitativas) de UniFrac[1]​ son ampliamente utilizadas en ecología microbiana, donde la primera representa la abundancia de organismos observados, mientras que la segunda solo considera su presencia o ausencia.

Todos los taxones encontrados en una o ambas muestras se colocan en un árbol filogenético.

La distancia entre las dos muestras se calcula entonces como: Esta definición satisface los requisitos de una métrica de distancia, siendo no negativa, cero solo cuando las entidades son idénticas, transitivas y conformes a la desigualdad triangular.

Los autores argumentaron que las distancias UniFrac ponderadas y no ponderadas ponen demasiado énfasis en linajes abundantes o raros, respectivamente, lo que lleva a "pérdida de poder cuando el cambio de composición importante ocurre en linajes moderadamente abundantes".

Tres ejemplos de la desigualdad triangular para triángulos con lados de longitud x , y , z . El ejemplo superior muestra un caso en el que z es mucho menor que la suma x + y de los otros dos lados, y el ejemplo inferior muestra un caso en el que el lado z es solo un poco menor que x + y .