Durante su militancia en el primero llegó al cargo de secretario general del EPK-PCE en Álava en 1987, puesto que ocupó hasta 1991.
Al fracasar este proyecto e integrarse el PTE en el PSOE, Prieto ingresó en el Partido Socialista de Euskadi-PSOE.
[1] Tras su ingreso en el PSE-PSOE, Prieto fundó una empresa del sector de la construcción.
En 1999 fue elegido procurador en las Juntas Generales de Álava y, en el marco del pacto con el Partido Popular que llevó a Ramón Rabanera a ser Diputado General de Álava, Prieto fue elegidido vicepresidente de las Juntas Generales.
Tras las elecciones de 2007, en las que quedó en segundo lugar, apenas a 200 votos del Partido Popular, le faltó un voto para alzarse con la Diputación General (en la segunda ronda, Prieto obtuvo 15 votos, los 14 del PSE-EE y uno de Ezker Batua, por 16 del candidato del PNV, Xabier Agirre, que obtuvo los 14 de su partido y 2 de EA).