Fue una figura influyente en el pensamiento alemán.
Su obra Las doctrinas sociales de la Iglesia y los grupos cristianos (Die Soziallehren der christlische Kirchen und Gruppen), publicada por primera vez en 1912, es una obra fundamental en el método histórico y el tratamiento revisionista del protestantismo.
En el ámbito estrictamente teológico, se puede decir que, si bien ya Adolf von Harnack había dado un fuerte impulso al estudio de los orígenes del cristianismo, siempre en búsqueda de aquel núcleo original que con el tiempo se había corrompido, sería Troeltsch quien introdujo la necesidad del estudio comparado de las religiones y de la cultura.
Esto, no sólo con la finalidad de evidenciar mejor los aspectos propios del cristianismo, sino de considerar al cristianismo como una religión histórica, parte del devenir de las ideas religiosas que han acompañado al hombre.
Existen dos obras completas de Troeltsch, la primera fue un proyecto que comenzó cuando aún Troeltsch estaba vivo y se compone de cuatro volúmenes: La segunda es la Kritische Gesamtausgabe, publicado por la editorial Walter de Gruyter (22 vols) entre 1998-2022