El Torneo de Reserva 2008/09 fue la sextoagésima novena edición del Campeonato de Primera División de Reserva de Argentina organizado por la Asociación del Fútbol Argentino.
Participaron un total de 20 equipos, todos participantes de la Primera División 2008/09.
Banfield se consagró campeón del torneo.
De los 20 equipos, participaron 19 en la edición ya que Gimnasia y Esgrima de Jujuy desistió: Se llevó a cabo en una dos ruedas, por el sistema de todos contra todos, invirtiendo la localía y consagró un campeón.
La tabla final de posiciones del torneo se estableció por acumulación de puntos.