Basilio nació en la ciudad de Palermo en el antiguo Italia en el año de 1580, iniciando con estudios religiosos desde niño.

El padre Tomás Basilio pidió ir a la Nueva España, y en el año de 1616 llegó ahí comenzar con su trabajo como misionero y explorador.

Un año después, en 1617, acompañó al padre Andrés Pérez de Ribas en un viaje a Sinaloa partiendo desde el río Mayo,[1]​ y en su paso visitaron y fundaron misiones religiosas en lo que hoy es el Valle del Yaqui,[2]​ que se usaron para enseñar el catolicismo a los indígenas yaquis.

[3]​ En el pueblo de Tórim, Basilio aprendió la lengua yaqui para así escribir en ese dialecto enseñanzas para los nativos.

Entre Pérez de Ribas y Basilio establecieron un rectorado independiente al de Sinaloa en el cual iban a trabajar, llamado Rectorado de San Ignacio del Yaqui.