Posteriormente, hubo un despoblamiento masivo debido a las epidemias traídas por los españoles y a los malos tratos de los encomenderos lo que dio como resultado a una migración de grupos indígenas durante gran parte del Virreinato de Nueva España.

Al reformarse durante el siglo XVIII en la Nueva España a una nueva división política y territorial, Tlacoachistlahuaca pasó a depender del partido de Ometepec en la intendencia de Puebla.

22, Tlacoachistlahuaca se constituyó como la cabecera del municipio de mismo nombre.

[5]​ Cabe destacar, que acontecimientos como la guerra de Independencia, la instauración de la república federal o la reforma no fueron de gran trascendencia en la justicia social del pueblo y la región puesto que los hacendados siguieron teniendo gran dominio sobre las tierras durante el siglo XIX.

Con base a los datos que presentó el Conteo de Población y Vivienda llevado a cabo por el Instituto Nacional de Estadística y Geografía en el año 2010, la población de Tlacoahistlahuaca tenía hasta ese año una población total de 4 359 habitantes, dividiéndose ésta cifra por sexo, 2 094 eran hombres y 2 265 eran mujeres.