El consenso llegó a su fin tras el hallazgo en América de yacimientos arqueológicos con presencia humana mucho más antiguos, entre ellos Monte Verde en el sur de Chile, lo que dio paso a la teoría del poblamiento temprano, que es la más aceptada actualmente.
La teoría expone que los sitios arqueológicos datados antes de trece mil años tienen muy poca aceptación en la comunidad científica internacional, y principalmente entre los científicos norteamericanos seguidores de Aleš Hrdlička.
Actualmente la teoría del poblamiento tardío (Clovis) ha sido puesta seriamente en cuestión por una serie de hallazgos y estudios arqueológicos, lingüísticos y genéticos que están produciendo crecientes evidencias sobre presencia humana en América muy anterior.
Estos estudios, que pueden ser definidos como teoría del poblamiento temprano o pre-Clovis, no solo están cuestionando la fecha de llegada de los primeros seres humanos, sino, con ella, el origen y las rutas utilizadas para llegar y para extenderse por el continente.
Actualmente la teoría del poblamiento tardío ha perdido sustento y se considera que la Cultura Clovis no representa la cultura ancestral de los demás pueblos americanos.