Su obra más famosa es Slam Dunk, con temática de baloncesto.

Su primer éxito como autor fue la conquista del prestigioso Tezuka Show, gracias a su obra Kaede Purple, centrada en el baloncesto.

También trabajó por unos meses como asistente del dibujante Tsukasa Hōjō, autor de City Hunter.

Se trataba de una obra de gran calidad gráfica y que combinaba un tratamiento emotivo y realista del baloncesto con un sentido del humor desbordante que lo hizo muy popular, en el mismo anime de Slam Dunk Inoue ha aparecido en algunos capítulos de la serie explicando las reglas básicas del baloncesto bajo el nombre "Dr T".

[5]​ Sin embargo, no consiguió otro gran éxito hasta que comenzó a publicar Vagabond,[6]​ una historia basada en la vida de Musashi Miyamoto, un guerrero legendario japonés, que sigue publicando actualmente.