[2]​ Con anterioridad se publicó la presencia de esta microalga en vida libre en el océano[1]​ y en relaciónes simbiótica intracelular con corales, anémonas, medusas, zoantarios, nudibranquios, cilioforos, foraminíferos y esponjas o simbiosis extracelular con almejas gigantes[3]​.

De tal manera que lo que antes se definía como Symbiodinium hoy puede variar en disntitos clados de la familia Symbiodiniaceae donde Symbiodinium se utilizaría exclucivamente para el clado A.

Existen varios gremios ecológicos, incluyendo abundantes especies de hospedantes específicos y hospedantes generalistas (1), especies de bajo fondo y potencialmente oportunistas (2), y especies no simbióticas estrechamente relacionadas con el bioma del coral (3) y/o ocupando hábitats no asociados (4).

[8]​ Las Symbiodinium son especies cruciales para los arrecifes coralinos, ya que su impacto en la comunidad es extremadamente grande en relación con su fracción del total de la biomasa de la comunidad.

[9]​ Los corales hermatípicos, aquellos que con sus esqueletos construyen los arrecifes, tienen especies de Symbiodinium, y son dependientes en gran medida de ellas, limitando así su crecimiento a la zona fótica del arrecife.