Actualmente es un entrenador sin equipo después de ser cesado por el SC Paderborn, que juega en la 2.
Tras superar la fase de grupos como segunda (una victoria, un empate y una derrota), Alemania avanzaría hasta la final, en que Dinamarca se impuso 2-0.
Por su papel clave, Effenberg fue elegido en el Equipo del Torneo junto a Andreas Brehme, Jürgen Kohler y Thomas Häßler.
Entonces se convirtió junto a Jens Jeremies en el dueño de un mediocampo bávaro casi inconquistable.
Esa triunfante temporada 2000-01 le valió asimismo el premio de UEFA Club Footballer of the Year.
A partir de ese día creció el descontento con Effenberg en la selección y apenas tuvo más protagonismo.
Ese incidente valió en Alemania para que el dedo corazón fuera llamado «Effe».