[4]​[5]​[6]​ El juego tiene lugar en la región de Tintelia, habitado por los inklings y los octolings endurecidos por la batalla.

La historia tiene lugar aproximadamente un año y medio después de los eventos del festival Caos vs Orden, en una ciudad llamada Tintelia (también conocida como la "ciudad del caos"), estacionada dentro de la misma región desértica.

Cuttlefish recluta al jugador como el Agente 3 del New Squidbeak Splatoon y le asigna la tarea de recuperar el Great Zapfish, que una vez más desapareció, que alimenta a Splatsville.

Con la ayuda de una inteligencia artificial llamada O.R.C.A, exploran la ciudad, que los difusos octarianos han convertido en una base.

Forman una alianza con New Squidbeak Splatoon y se convierten en empleados de Squid Sisters.

Mientras Cuttlefish revive en forma de calamar primitivo por las lágrimas del Capitán, Grizz lanza el cohete, pero Deep Cut le da al Agente 3 un impulso hacia él con la ayuda de sus anguilas y tiburones domesticados y un equipamiento espacial.

La historia tiene lugar en "lo que ha sido del" Centro de Cromópolis, el centro principal de Splatoon 2, en "lo que habría pasado" si el Equipo Orden hubiera vencido al Equipo Caos.

Agente 8, el protagonista de Octo Expansion, ha sido transportado inesperadamente a un mundo misterioso construido con sus propias reglas únicas.

Ahora, Agente 8, las Cefalopop (nombre del dueto formado por Perla y Marina) y Acht deben volver a la Torre del Orden, superando desafíos bajo ciertas reglas para luego detener a Ordon.

Marina intenta explicar a Ordon por qué su idea de un mundo perfecto es disfuncional, sin embargo, Ordon falla debido al concepto de su creador negándolo antes de decidir que el Agente 8 y todo lo caótico debe ser destruido, evolucianándose a Ordominio y dando inicio a la pelea.

El Agente 8 lucha contra Ordominio, pero es demasiado fuerte y activa un programa que activa una Decoloración masiva a todo el mundo, noqueando al Agente 8 y a todos.

Al igual que sus predecesores en la serie Splatoon, el juego consiste en partidas competitivas multijugador en línea junto con un modo para un jugador basado en la historia.

Splatoon 3 tiene una jugabilidad similar a las entradas anteriores de la serie, que han sido disparos en tercera persona.

Splatoon 3 amplía esto agregando nuevas armas principales y especiales al juego.

Los partidos de Territorial duran tres minutos, y el equipo que cubra un porcentaje más alto del campo es declarado ganador.

También regresarán los 4 modos de juego del combate competitivo (Torre, Pintazonas, Almejas y Pez Dorado) siguiendo las mismas reglas que el juego predecesor, solo que ahora el modo se llama Combate Caótico.

[11]​ También se incorpora nuevas funciones en Tintelia, como los accesorios, los casilleros, el combate carta territorial, entre otros.

[14]​ Los puntos de generación regulares todavía están presentes en el escenario, pero no se ha confirmado que sean utilizables.

Además se incorpora 4 nuevos grandes salmónidos: Viga, Chapótero, Tapaollas y Artilleroide.

[22]​ Nintendo también anunció que el juego sería compatible con amiibo, con varias figuras nuevas que se pueden usar para tomar fotos con los personajes en el juego y recibir artículos de equipo especiales, similar a los títulos anteriores de Splatoon.

Mientras tanto, la segunda entrega, titulada "La Cara del Orden" consiste a una nueva historia donde se ambienta en un pueblo fantasma, y que estarán las Cefalopop de Splatoon 2 en ello.

Los 2 personajes tendrán que entrar a la Torre del Orden (anteriormente el Vestíbulo de Splatoon 2) donde con cientos de combates, tendrán mejoras mientras vayan a resolver el enigma, mientras que serán guiados por Acht (más conocida como Dedf1sh quien ha hecho el soundtrack de los combates en Splatoon 2: Octo Expansion).

[33]​ Splatoon 3 recibió críticas "generalmente favorables" según el agregador de reseñas Metacritic.