Considerado fuerte para el juego aéreo, impresionó en el Partizán antes de pasar siete temporadas en LaLiga al servicio de tres clubes, disputando 208 partidos y marcando 31 goles, principalmente con el Tenerife.Nacido en Novi Sad, antigua República Federal Socialista de Yugoslavia, Jokanović comenzó a jugar en el club de su ciudad natal, el FK Novi Sad, haciendo su debut con la FK Vojvodina en la temporada 1988-89.El trío se combinó durante 85 partidos y cinco goles cuando los gallegos ganaron su primer título de liga.[4] Posteriormente se retiró del fútbol profesional tras jugar solo tres meses en la Segunda División española con el Ciudad de Murcia.[8] Jokanović llevó al Partizán a otro doblete en su primera temporada completa, ganando la liga por un margen de 19 puntos sobre su ex equipo Vojvodina.[15] El 7 de octubre de 2014, Jokanović fue designado con un contrato a corto plazo al frente del Watford, el club del Championship inglés, su cuarto entrenador en cinco semanas.[18] Sin embargo, no llegó a un acuerdo con el club para renovar su contrato, siendo sustituido por Quique Sánchez Flores.[25][26] El 14 de noviembre, sin embargo, después de siete resultados consecutivos sin ganar y con la clasificación del equipo en último lugar, fue destituido y reemplazado por Claudio Ranieri.Su llegada significó una apertura hacia un fútbol atractivo que sirviera de ejemplo para el resto de equipos, compartiendo banquillo con entrenadores como Xavi Hernández o Rui Faria, entre otros.