En las memorias de Jean Lebeuf se afirma que este instrumento fue inventado por el canónigo Edmé Guillaume en 1590 en Auxerre (Francia) y fue utilizado inicialmente para acompañar los coros en los oficios religiosos.

La adición de las teclas le permitió tener una mejor entonación y gran virtuosismo.

Este nuevo empleo fue frecuentemente relacionado con la carga simbólica religiosa del instrumento; Mendelssohn le consagra una parte de su oratorio Paulus; Berlioz lo utiliza en la sinfonía fantástica Dies Irae.

Tras un abandono progresivo desde mediados del siglo XIX, el serpentón fue redescubierto en los años 1970 en Inglaterra por el luthier Christopher Monk, quien lo fabricó sobre un modelo de Jean Baudoin.

Luigi Morleo compuso en 2012 "Diversità: NO LIMIT" - Concierto para Serpent and String Orchestra, Estreno mundial en el Conservatorio de Música "Nino Rota" - Monopoli (Ba) - Italia.