En 1920 contrajo matrimonio en Sandoná con Rosa Florinda Cabrera (1895-1989), de cuya unión nacieron 12 hijos: Alfonso (1920-1921), Inés Dolores (1922-2005), Laurencio (1924-2007) (teniente coronel PNC), Edmundo (1927-2000), Lucía (1929-2011), Stella, Sergio Elías, Juan Augusto Nicolás (1935-2001), Eduardo (1937- 2010); José Vicente (1935-1975), Francisco Mardoqueo de Sales (1942) y Alejandro.

[1]​ Sergio Elías Ortiz curso sus estudios de primaria en Popayán en el colegio Champagnat de los hermanos Maristas, allí se familiariza con el francés, que dominará posteriormente, aprende el inglés y el latín, que lo conducirán a sus fuentes de origen.

Este grado de maestro será el que imprimirá un carácter especial a su personalidad.

[1]​ Más adelante, Sergio Elías se asocia con sus condiscípulos Luis Samuel Fajardo y Temístocles Pérez Delgado y forman un grupo de autodisciplina y mejoramiento académico, mediante la lectura metódica de libros, el ejercicio de la crítica y la producción de pequeños ensayos.

"[3]​ Las "propuestas modernizantes" de Ortiz fueron su "contribución al estudio del patrimonio cultural nacional", su "impulso a la escritura como medio para reivindicar el papel de una región en el contexto nacional", y su "importancia de transmitir la historia mediante la instrucción pública".