A medida que va pasando la serie se va haciendo más fuerte igualando a los Caballeros Dorados y los Dioses, capaz de elevar su poder hasta el infinito y ganar nuevas habilidades como recorrer 300.000 kilómetros por segundo, despertar el Arayashiki (octavo sentido) y posee una fuerza sobrehumana capaz de derrotar a cualquier enemigo.

Cuando era más pequeño, Seiya muchas veces sintió temor de seguir con su entrenamiento impulsado por la idea de que su cabeza fuera una más en la colección de Cassios ante un posible enfrentamiento con él (que se daría luego cuando Seiya va a obtener su Cloth correspondiente) y también por la discriminación existente en el santuario con respecto a los japoneses.

Un hecho muy importante en la historia es que Seiya tiene una motivación personal para hacerse Santo: reencontrarse con su hermana mayor, Seika, de quien fuera separado en su infancia por su propio padre, Mitsumasa Kido.

Seiya también quiere salvar a Kōga, cuando este se volvió el huésped de Apsu, aunque demuestra la tenacidad y determinación de luchar contra él, aunque tenga que matarlo.

Al salir vencedor, el mismo Patriarca del Santuario le entrega la armadura de bronce Pegaso.

Seiya se despide de su maestra Marin y viaja rumbo a Japón.

Seiya le pregunta por el paradero de su hermana Seika, pero Miho se pone a llorar por no poder ayudarle.

Geki aprovecha la fuerza física de sus brazos e inmoviliza a Seiya deteniéndolo por el cuello.

Al día siguiente Miho junto con Makoto, Akira y Tatsuya, 3 de los niños del orfanato, quedan con Seiya para ayudarle a hacer la mudanza.

Al día siguiente Seiya volvía a combatir en el Torneo Galáctico, esta vez contra Shiryū de Dragón, pero Miho prefiere no ver el combate y rezar por Seiya en una iglesia.

Sin embargo Seiya con un ataque suicida, logra que el Dragón mismo rompa su escudo y su puño, con lo cual su armadura queda inservible.

Ikki revela que ha planeado tomar venganza contra la Fundación Graude, por haberlo maltratado y enviado a la Isla de la Reina Muerte cuando era pequeño.

En el enfrentamiento con los caballeros negros, liderados por Ikki, le tocó enfrentarse con su doble, el caballero negro de Pegaso, al cual derrota fácilmente, pero a la vez, es alcanzado por los Meteoros Negros de su rival, que lo llevan al borde la muerte y de la que es salvado por Shiryū, que golpea sus puntos vitales para así extraer la sangre infectada.

Ikki, en un último esfuerzo ataca a Dócrates, resultando ambos sepultados por el derrumbamiento de la montaña.

En su intento por rescatarla, Seiya queda mal herido, luego de arrojarse a un profundo abismo con Saori.

Templo de Atenea: Seiya llega finalmente al cuarto del Patriarca al desaparecer el camino de rosas dejado por Afrodita, allí encuentra a un hombre que está arrepentido por todo lo sucedido y que además le explica como puede salvar a Atenea.

Saga, furioso porque sus planes habían sido arruinados, promete acabar con la vida de Seiya.

Luego se encuentra con Alberich de Megrez, quien lo encierra en la amatista, junto a Marin, quien también había sido derrotada.

Finalmente, Seiya viste la armadura de Odín y destruye el Anillo Nibelungo.

Ahí se encuentran con la sirena Tetis y con el general marino Dragón de Mar; aunque ellos no saben realmente quien es.

Más tarde usaría su Pegasus Ryūsei Ken para, junto a Shiryū, Hyōga y Shun, elevar las Exclamaciones de Atenea fusionadas.

En un ataque desesperado Seiya logra golpear a Radamanthys y ambos caen por el agujero que los lleva al Infierno.

Caronte finalmente accede a llevarlos al ver el medallón de Shun.

Seiya le confiesa que él tiene la armadura de Atenea pero era un plan para librarse del Cocitos y Valentine lo libera para pelear y quitarle la armadura de Atenea, pero ahora el Pegaso obtiene la victoria.

Tanto es el entusiasmo y valentía del suceso que la mismísima Atenea lo incita a eleva su cosmos a niveles divinos, por lo que su armadura se convierte en Armadura Divina de Pegaso.

Se enfrenta a Hades junto con Ikki de Fénix cuando este recupera su cuerpo original.

Es presentado como un héroe legendario luego de haber luchado contra varios dioses en el pasado.

Aquel meteoro traía consigo una nueva fuerza elemental que cambió de forma a las Armaduras y las características del Cosmos, el cual ahora se basaba en elementos.

La armadura de oro lo protege en cuatro ocasiones (cuando lucha contra Ikki, cuando se enfrenta con los tres santos de plata que vinieron con Aioria, en la lucha contra Poseidón y durante el enfrentamiento con Tánatos) y cuatro veces en las películas.

Sin embargo, en la encuesta de las técnicas, su Pegasasu Ryu Sei Ken ocupó el primer lugar.