El Campeonato Ecuatoriano de Fútbol de Segunda Categoría 1989 fue la edición N.º 16 de la segunda división del fútbol ecuatoriano, este torneo es el tercer escalafón en la pirámide del Fútbol Ecuatoriano por detrás de la Serie A y Serie B, para esta edición nuevamente el torneo sería considerado el tercer nivel y nuevamente sería para el ascenso a la Serie B, el campeón del torneo sería el cuadro del Juvenil que sería el 3° equipo esmeraldeño en salir campeón de la Segunda Categoría detrás de Esmeraldas Petrolero en el torneo de 1984 y Juventus en la edición de 1987, mientras que el subcampeonato sería para el cuadro de LDU(L) que en su segunda participación lograría el ascenso y se convertiría en el primer cuadro lojano en ascender.
[1] El Juvenil lograría su primer título que le daría la oportunidad de participar en el Campeonato Ecuatoriano de Fútbol Serie B 1990, mientras que el cuadro de LDU(L) obtendría el primer subcampeonato que también le daría la oportunidad de participar en aquel campeonato.
Los equipos de Tungurahua e Imbabura.
Clasificados como Primeros (Ganadores de cada Grupo)
Pts=Puntos; PJ=Partidos jugados; G=Partidos ganados; E=Partidos empatados; P=Partidos perdidos; GF=Goles a favor; GC=Goles en contra; Dif=Diferencia de gol