[2]​ Por ser un miembro del gabinete legal, el presidente de la República lo nombra y remueve libremente y ejerce sus funciones de acuerdo a sus competencias.

Debido a tal característica son los secretarios que, por su tácita condición militar, no ejercen como políticos —aunque no por ello están imposibilitados en militar en un partido político— pero sí como funcionarios, razón por su militancia no es importante para el cargo .

A diferencia de otras secretarias cuyo nombre y funciones ha evolucionado con el tiempo, la SEMAR ha mantenido intacta desde su fundación, por ello todos sus titulares han tenido la histórica denominación de «secretario de Marina».

[5]​ Esta es una lista de todos las personas que han ocupado la titularidad del cargo donde se incluye su nombre, periodo, estado de nacimiento y presidente que lo nombró.

La mayor y menor duración en el cargo es la siguiente: De los veinte exsecretarios existentes hay cuatro que viven en la actualidad.