La Schola Cantorum Basiliensis fue fundada en 1933 en Basilea por Paul Sacher (1906-1999) como un instituto de investigación y enseñanza para la música antigua.
Después de su inicio, el chelista y gambista August Wenzinger (1905-1996) y la violinista y pedagoga musical Ina Lohr (1903-1983) ejercieron una influencia decisiva sobre la escuela.
Desde el año 2005 al 2012, la escuela fue dirigida por Regula Rapp.
Cuenta aproximadamente con 200 alumnos venidos de diferentes países e imparte tres cursos diferentes: Medieval/Renacimiento, Renacimiento/Barroco y Barroco/Clásico.
La enseñanza teórica se basa en el periodo del curso escogido, estudiándose entre otras materias: notación, escritura, danza, historia de la música, organología, bajo continuo, canto gregoriano, etc.