La bóveda, de cañón apuntado en sillería, está soportada por seis contrafuertes.
Fue realizada con sillar de buena calidad bien tallado y asentado.
Justo enfrente, se encuentra el acceso a la Gruta de la aparición (7).
Detrás del Altar Mayor, en el camarín de la Virgen (4), se conservan diversas reliquias.
Al pie del templo, se sitúan el coro (9) elevado y la Capilla de la Reconciliación (10), a la que también se puede acceder por la puerta (11) situada en el suroeste de la fachada sur.