San Francisco de Sigsipamba está ubicada al norte del volcán Cayambe, en la cordillera oriental de los Andes septentrionales del país.
[1] Es un lugar montañoso, que divide el valle subtropical de la amazonía, tiene un paisaje de páramo con numerosos sigses, y riquísima flora y fauna.
La altitud comprende desde los 1.960 hasta los 3.920 msnm y las zonas de vida características son: bosque húmedo premontano, bosque húmedo montano, bosque húmedo montano bajo y páramo pluvial sub alpino bajo.
[5] En el transcurso de 26 años (1991-2017), se evidenciaron cambios en el uso del suelo y cobertura vegetal en la Parroquia San Francisco de Sigsipamba.
Para el año 2017, el bosque nativo se redujo en 3.541 ha (20,4%) y el páramo en 1.267 ha (7,3%).