[3]​ Pero este intento secesionista fue derrotado por el general conservador guatemalteco Rafael Carrera, quien impuso un régimen duro y hostil para los liberales altenses, pero bondadoso para los indígenas de la región.

Esta última es considerada como la segunda erupción más destructiva de la región centroamericana del siglo xx.

[6]​ El topónimo «San Carlos Sija» es de origen español y maya, aunque la historia sobre el mismo ha tenido versiones contradictorias.

[12]​ Sus límites geográficos son los siguientes:[12]​ Ante el interés del pueblo indígena por acabar con los impuestos eclesiásticos y el tributo impuesto por la corona española, los líderes indígenas Atanasio Tzul y Lucas Aguilar lucharon en contra del poder de la Capitanía General de Guatemala representado por el capitán general, el Arzobispo de Guatemala, Ramón Casaus y Torres, las órdenes regulares, la élite ladina local y los caciques de Totonicapán.

Durante la cuaresma de 1820, cuando se supo que Fernando VII había sido obligado a poner nuevamente en vigencia la Constitución absolutista, Aguilar y Tzul realizaron gestiones ante el alcalde mayor de Totonicapán para verificar el hecho.

Así, se dio paso al rechazo del tributo, la remoción del Alcalde Mayor, José Manuel Lara de Arrese y la imposición de un gobierno propio.

[1]​ De tal manera que la constitución del Estado de Guatemala promulgada en esa misma fecha[a]​—creó los distritos y sus circuitos correspondientes para la administración de justicia según el Código de Lívingston traducido al español por José Francisco Barrundia y Cepeda; siendo Totonicapán sede del circuito del mismo nombre en el distrito N.º 9 (Totonicapam); a este circuito pertenecían Salcajá, San Cristóbal, Shejul, Vobos (Sibilia), Sija y San Francisco.

Encolerizados, los indígenas acudieron al caudillo conservador Rafael Carrera, en busca de protección.

[17]​ Tras algunas escaramuzas, los ejércitos se enfrentaron en Sololá el 25 de enero de 1840; Carrera venció a las fuerzas del general Agustín Guzmán e incluso apresó a éste[18]​ mientras que el general Doroteo Monterrosa venció a las fuerzas altenses del coronel Antonio Corzo el 28 de enero.

[6]​ En el año 2003, la agricultura conformaba el 58% de la actividad productiva del municipio, que incluye tanto los cultivos anuales como los permanentes.

Los principales productos agrícolas son: maíz, frijol, trigo, haba y avena.