La superficie del lago está cubierta en un 23% por islas, un 39% por juncos y un 38% por aguas abiertas.

Ocasionalmente, la lechuga del Nilo ( Pistia stratiotes , una planta flotante, cubre vastas áreas de aguas abiertas.

Grandes extensiones de arcillas oscuras bordean la orilla sur del lago.

Alrededor del lago crecen baobabs, palmeras datileras, mirra africana y jojoba india.

También alberga dos especies casi endémicas de roedor: Mastomys verheyeni y el gerbo del lago Chad, Taterillus lacustris.