La Ruta Nacional 39 fue una ruta colombiana de tipo troncal que iniciaba en el sitio de Petaqueros (municipio de Fresno), departamento del Tolima saliendo de la Ruta Nacional 50 y finalizaba en el municipio de Pensilvania ,departamento de Caldas.
Era una ruta que conectaba los municipios del centro-oriente de Caldas con la Ruta Nacional 50 y de ahí con el resto del país.
La ruta fue establecida en la Resolución 3700 de 1995 y eliminada por la Resolución 339 de 1999 donde sus tramos ahora forman parte de la Red Vial Secundaria de los departamentos de Caldas y Tolima manteniendo la misma nomenclatura.
La ruta estaba dividida de la siguiente manera: Las ciudades y municipios por los que recorre la ruta son los siguientes (fondo azul: recorrido actual; Fondo gris: recorrido anterior o propuesto; texto en negrita: recorre por el casco urbano; texto azul: Ríos): Actualmente la ruta no posee kilómetros entregados en Concesión para su construcción, mejoramiento y operación.