La conquista española fue liderada por el coronel Baltasar Maldonado enviado por don Gonzalo Jiménez de Quesada.

En 1.864 este grupo de personas levantó las primeras casas en el lugar que hoy ocupa Manzanares.

En 1870 se reclamó el reparto de las tierras: cada varón residente en Manzanares, mayor de 15 años tenía derecho a 32 hectáreas; para los hombres casados y las viudas se aumentó esa cantidad en 5 hectáreas por hijo menor de 21 años que viviera con la familia.

Estos nuevos pobladores, sin preocuparse por los títulos de adjudicación ocuparon tierras que ya estaban repartidas y comenzaron a presionar para lograr el reconocimiento de sus derechos.

Está conformada por tres franjas horizontales e iguales: La franja amarilla se ubica en la parte superior y significa la riqueza del pueblo; en el centro, la franja blanca significa paz, y en la parte inferior el color verde que significa la esperanza en el progreso del municipio