Posteriormente, obtuvo su licenciatura en teología en 1959, en la Universidad de Innsbruck (Austria).
Cursó estudios en la Pontificia Universidad Gregoriana de Roma, donde consiguió su doctorado en derecho canónico en 1962.
Habló castellano, inglés, latín, francés, italiano y alemán.
Fue coadjutor en la Parroquia del Sagrario de la catedral metropolitana.
Se desempeñó como defensor del vínculo matrimonial en el tribunal arquidiocesano.
Jugó un papel determinante en llevar a su término la guerra civil que azotó su país por 36 años.
Junto con el obispo Juan Gerardi, el futuro Cardenal era miembro de la Comisión Nacional de Reconciliación, y entre 1987 y 1993 fue su presidente.
En la Curia Romana fue miembro del Pontificio Consejo para la Cultura y de la Comisión para América Latina.
Además, para sucederlo el mismo Papa nombró a Mons.