Stone fue discípulo de Hermann Kahn, John Maurice Clark y John Maynard Keynes y compañero de James Meade en el Servicio Central de Información Económica durante la II Guerra Mundial.
Stone y Meade sistematizaron el uso de un volumen creciente de información estadística en un sistema organizado, que Stone refinó hasta convertirlo en la base del moderno análisis macroeconómico.
Inventó un esquema de doble entrada, extensión del sistema de partida doble empresarial, en un modelo económico con cuatro agentes agregados: las familias, las empresas, el sector público y el sector exterior.
El sistema creado por Stone ha permitido su uso por países y corrientes de pensamiento muy diversas.
Entre sus principales obras destacan: "Renta nacional, contabilidad nacional y modelos económicos" (en colaboración con Meade, 1944), "La función de las medidas en economía" (1951) e "Input-output en las cuentas nacionales" (1961).