Probablemente fue realizado para la iglesia de Santa Maria dei Servi de Perugia, donde permaneció hasta 1542.

Fue demolida en la década de 1540 para dar paso al foso de la Rocca Paolina y los Servitas se trasladaron a la iglesia de Santa Maria Nuova con su gran colección de obras de arte, entre ellas la Transfiguración, que fue trasladada a la capilla Graziani de esa iglesia, donde permaneció hasta su traslado a su actual sede en 1863.

A su lado están Moisés y Elías, arrodillados sobre la misma nube.

En el registro inferior están los apóstoles Juan (arrodillado), Pedro y Santiago (a la derecha).

La composición retoma en gran medida los dibujos existentes realizados por Perugino, con los dos registros y la mandorla utilizados originalmente en su ya perdida Asunción de la Capilla Sixtina.