El área abarca bosque húmedos tropicales de tierra firme, inundables (llamados guandales) y manglares.

En las zonas de manglares hay varios ecosistemas acuáticos asociados a la inundación temporal por las mareas.

El área incluye además algunas zonas habitadas donde existen cultivos en pequeña escala y pastizales para ganado.

Los humedales integran el sistema estuarino más grande y mejor conservado del Pacífico Sur.

Esta área protegida también alberga importantes poblaciones de especies amenazadas a nivel global y endémicas del Chocó, como la pava de monte (Penelope ortoni), la guacharaca' colorada (Ortalis erythroptera), la chilacoa café (Aramides wolfi), la atila ocrácea (Attila torridus) y el mielero pechirrojo (Dacnis berlepschi).