Poco después de la independencia, en 1831, México estableció una embajada no-residente concurrente a Paraguay desde Buenos Aires, Argentina.

En 1943, ambas misiones diplomáticas se elevaron al rango de embajadas.

En 1997, el presidente paraguayo Juan Carlos Wasmosy también realizó una visita de estado a México.

[1]​ En 2003 se creó el grupo 'Mecanismo de Consulta y Coordinación México-Paraguay' para que ambas naciones se reúnan periódicamente para analizar proyectos conjuntos en curso y discutir futuros proyectos mutuos.

[7]​ Las empresas multinacionales mexicanas como Cemex, Claro y Grupo Bimbo (entre otros) operan en Paraguay.