A fines de 1865 encabeza una revuelta popular contra Melgarejo que concluye en virtual descalabro.

Sin embargo, el señor Peña es una de las excepciones a este caso, pues como él también Aniceto Arce, Mariano Baptista, Lucio Pérez Velasco, Eleodoro Villazón, Valentín Abecia y José Carrasco (7 de 18 vicepresidentes) cumplieron con aquella disposición vigente por esas fechas.

En “La Estrella del oriente”, publica los primeros trabajos que tiene elaborados en la materia de botánica y dispuestos en orden alfabético.

Se publica en Tacna la obra de toda su vida, que lleva el nombre Flora Cruceña.

Expuesto en forma alfabética, sólo abarca hasta la letra M, pues los editores no disponen del original completo.