Su primera incursión en la vida pública fue su participación en la revuelta contra el presidente Horacio Vásquez en 1930, dirigida por Rafael Estrella Ureña, y apoyada por el entonces jefe del Ejército, el General Rafael Leónidas Trujillo.Pero, durante su breve intensa Presidencia, el Dr Bonnelly del Gobierno escribió y pasó algunos de los principios en la legislación del país, como las leyes de Bancos y Vivienda, que todavía se usan.En 1966, Bonnelly hizo una infructuosa carrera para la presidencia en una elección que fue ganada por el doctor Joaquín Balaguer, con un fuerte respaldo del gobierno de los Estados Unidos que en ese entonces era Lyndon Johnson.Durante dos semanas, Bonnelly y Balaguer mantuvieron un debate público publicado en los principales periódicos del país, que terminó con Balaguer aceptando su derrota y se proclamó a Antonio Guzmán Fernández, candidato por el Partido Revolucionario Dominicano (PRD).En 1979, se le concedió el Doctorado Honoris Causa por la Pontificia Universidad Católica Madre y Maestra (PUCMM).