Nacido en Francia, su familia se asentó en la Capitanía General de Santo Domingo alrededor 1820.

Su padre era Louis Fondeur y su madre era Marguerite LaJeunesse, Condesa De La Juvenile; tenía 5 hermanos.

Casó con Jacinta Castro y tuvo 5 hijos, él enviudó y se casó luego con María Luisa Fernández Fernández (1837–1895) y tuvo 10 hijos.

Fue designado Ministro de Asuntos Exteriores en 1867.

Fondeur Lajeunesse fue también presidente del Consejo Edilicio del Ayuntamiento de Santiago de los Caballeros.