[4]​ En 1974 se casó con su prima Blanca Benjumea Llorente (1947).

[5]​ El matrimonio tuvo seis hijos: Blanca, Rafael, José, Tilda, Enrique e Isabel.

Desde entonces y hasta su fallecimiento, Francisco Benjumea asumió la presidencia de su patronato, e impulsó las relaciones hispanolusas en diversas disciplinas científicas (arquitectura, medicina, economía, conservación del patrimonio, entre otras).

También creó en 2019 el Observatorio Permanente del Hispanismo, para unir sinergias en torno a los valores del hispanismo.

[9]​ Fue enterrado en el cementerio de Trujillo (Cáceres).