El río se dirige en su primera mitad directamente al sur, fluyendo en un amplio valle entre las Uraltau y otra cadena paralela, las montañas Irendyk.

Sigue al sur y atraviesa la frontera adentrándose en el óblast de Oremburgo.

El Sakmara fluye desde Kuvandyk, y durante un tramo de más de 150 km, en dirección paralela a unos 15-35 km aproximadamente a la del río Ural, considerado la frontera entre Europa y Asia.

En su parte baja, el río gira hacia el suroeste y tras pasar por Tatarskaja Kargala (3800 hab.

[1]​ Se congela a partir de noviembre hasta abril.