El Maly Anyuy ( en ruso: Ма́лый Аню́й; maly que significa "pequeño") es un río en la cuenca del Kolyma en el Lejano Oriente ruso.

El Maly Anyuy fluye aproximadamente hacia el oeste, al sur y al oeste de la cordillera Ilirney, haciendo una amplia curva junto a la cordillera Chuvanay - fluyendo primero hacia el norte y luego de nuevo hacia el oeste a los pies de la cordillera Kyrganay - en la región autónoma de Chukotka occidental.

[2]​[3]​ El cráter del meteorito El'gygytgyn se encuentra a unos 50 kilómetros (31,1 mi) de su nacimiento.

[4]​ Las localidades habitadas más importantes del valle de Maly Anyuy son Aliskerovo y Bilibino, a orillas de afluentes menores.

Entre los peces que se encuentran en Maly Anyuy se encuentran diferentes especies de truchas, salmones y golets (голец), así como el pelado .