En su curso adopta cinco nombres diferentes, desde las nacientes al litoral, relacionados con las categorías de quebradas, ríos secundarios y río principal.
A partir de estas confluencias, aguas abajo se denomina río Chilete.
En este en Valle se encuentra San Miguel de Pallaques, Tanón, Las Paltas y Llallán.
A partir del año 1988, a fin de permitir la regulación de las descargas del río, entró en operación el Reservorio Gallito Ciego, ubicado en el lecho del río Jequetepeque, ocupando las áreas comprendidas desde la parte baja de Tembladera hasta el lugar denominado Gallito Ciego.
Los ríos terciarios más importantes son: Llapa, Chacapampa, Tinte, Naranjo y Chotén, están en las partes altas y presentan condiciones climáticas húmedas y frías, formando la mayor parte de los medios ecológicos de punta del área, al igual que los valles cuatrígenos principales.