El río también es el hogar del salmón real o Chinook, lo que convierte a San José en la única ciudad importante de los Estados Unidos, a excepción de Anchorage en Alaska, a través del centro del cual los salmones nadan río arriba hasta su zonas de desove.

[6]​ Ambos tuvieron que ser alejados del río debido a los mosquitos en el verano y las inundaciones durante el invierno.

Históricamente, el río Guadalupe era aún más corto, y se originó varias millas más al norte, en el extremo corriente abajo de un gran pantano de sauces que ahora es "Willow Glen", California.

La inundación hizo imposible que los visitantes del juego entre los San Jose Sharks y Detroit Red Wings entraran al San Jose Arena para ver el juego.

En diciembre de 2004, se completó un proyecto para hacer frente a una "inundación del siglo".