El segundo sitio se conoce como Misión Santa Clara de Asís.
[5] El sitio actual, hogar de la primera universidad en Alta California, se remonta a 1828.
La tensión se alivió cuando doscientos indígenas construyeron una carretera, La Alameda (San José), para unir a las comunidades.
[8] Muchos nativos americanos huyeron al Valle Central de California, otros se quedaron localmente y trabajaron para los nuevos ranchos.
[11] El campanario tiene tres campanas; uno fue donado por el rey Carlos IV pero posteriormente destruido en un incendio.
El rey Alfonso XIII donó una campana de reemplazo, que se exhibe en el "Saisset Museum" (en la misión).