Discurre en dirección sur, en un curso paralelo al del río Juruena, en una zona accidentada con zonas de rápidos y cascadas, como las corredeiras (cascadas) de Cotovelo, Upui, Air, Fura Braço y Tucuriba, o las cachoeiras (zonas de rápidos y cascadas) de Bonnet, Pura y Moura.
Atraviesa en este curso alto las localidades de Terra Preta, Bom Lugar, Vila Porto Franco, Tucumã, Tucuriba, Vila Meriti y Ariranha.
En este tramo el río se ensancha mucho y atraviesa el territorio indígena de Coatá Laranjal.
Un brazo de este río forma el río Paraná-Urariá, que corre casi paralelo al río Amazonas durante unos 400 km, dejando entre ambos la isla Tupinambarana, una isla de 11.850 km² (la 66.º del mundo por tamaño), formada por llanuras aluviales y recorrida por pequeños ríos y lagos.
Los principales afluentes de este tramo del Paraná-Urariá son los ríos Abacaxis (610 km), Maués-Açu (370 km), Andira y Mamurú.