El río baña por su ribera derecha las ciudades de San Pedro y Baradero.

Ecorregionalmente, sus aguas se incluyen en la ecorregión de agua dulce Paraná inferior; mientras que los terrenos de sus márgenes inmediatos se adscriben en la ecorregión terrestre delta e islas del río Paraná.

[2]​ Al recibir por la derecha el curso del arroyo El Tala, el río Baradero pasa a ser, por un corto tramo, el límite entre el partido de San Pedro —en su margen derecha— y el partido de Baradero —en su margen izquierda—, situación jurisdiccional que se mantiene hasta la desembocadura del río Arrecifes —también por la derecha— curso fluvial que oficia de límite entre los citados partidos; a partir de este punto, ambas márgenes del Baradero pasan a pertenecer al partido homónimo.

Frente al balneario municipal de dicha ciudad —en el km 32 del río Baradero— su curso registra su profundidad mínima: 4 metros.

El río continúa discurriendo con típico fluir de río de llanura, siempre en dirección general noroeste-sudeste y marginado por terrenos inundables, aunque la alta barranca del Paraná se sitúa a pocas decenas o cientos de metros por su derecha.