Las elevaciones mínimas y máxima corresponden, respectivamente, a los 384 m s. n. m. en su desembocadura sobre el río Magdalena, y 3400 m s. n. m. en las estribaciones del Nevado del Huila.

[1]​ La cuenca del río Baché colinda con el departamento del Tolima, cerros, cuchillas y varias cuencas hidrográficas de quebradas y ríos, tal como se indica a continuación: La cuenca alta, zona donde nace el río Baché y algunos de sus afluentes, corresponde a las jurisdicciones municipales de Santa María, Teruel y Palermo, zona donde desembocan al Baché los ríos Yaya y Tune, así como las quebradas Amborco, San Miguel y Remuda.

La cuenca baja del río Baché pertenece a los municipios de Palermo, Neiva y Aipe, en donde este río recoge las aguas de las quebradas Santa María, El Arrayán, El Neme y la San Francisca, entre otras.

En esta cuenca, los campos petrolíferos de San Francisco y el Balcón, en conjunto, se sitúan sobre las microcuencas de las quebradas El Neme, La San Francisca y Guayabal, así como en las microcuencas de las quebradas Honda, Los Medinas, El Salado, La Raya, Jagualito y El Arrayán, entre otras.

[1]​ La microcuenca de la quebrada La San Francisca drena sobre la margen izquierda del río Baché, hacia el norte del caserío Peñas Blancas, a una altitud inferior a 450 m s. n. m. Esta microcuenca tiene una forma de oval-oblonga a rectangular-oblonga y una superficie aproximada de 15.23 km², cuyo punto más elevado se encuentra a los 1.275 m s. n. m., en el Filo de Cerro Chiquito.