Durante el siglo vii las tribus qarluq formaron un janato dirigido por un Yagbhu (príncipe), pero fueron absorbidas por el imperio de los Köktürks a finales del siglo vii.
Quedaron bajo la influencia china y participaron activamente en el combate contra la expansión musulmana de la región, hasta que traicionaron a los Tang en la batalla del Talas, en 751.
Tras la retirada de los chinos del Asia Central, los qarluq se convirtieron colectivamente al islamismo.
Durante los años 900, los Qarajánidas, que decían ser un joven clan de los qarluq, conquistaron la región controlada por el antiguo janato y crearon un imperio que comprendía el norte del Irán actual y algunas partes del Turquestán.
La región quedó bajo el control de los Qarakhanidas (y, en diferentes períodos, fueron también controlados por los selyúcidas y los kara-kitanos, hasta el 1206 que volvieron a ser un estado vasallo de los mongoles.