[1]​ Su nombre es un homenaje al coronel Remigio Morales Bermúdez, presidente de 1890 a 1894, en cuyo gobierno se concluyó la construcción de la vía del Pichis, que conectó la localidad al resto del país.

[3]​ En la década de 1890, los grupos caucheros comenzaron a establecerse en las orillas del río Azupizú, denominándolo Puerto Tukker.

En 1893 los pobladores locales se asentaron definitivamente en el emplazamiento territorial que hoy ocupa el municipio de Puerto Bermúdez, a orillas del Río Pichis, denominándolo Balarezo o Puerto Balarezo.

[2]​ Según los historiadores, el nombre original de lugar es Coriaqui, bautizado por los grupos nativos Asháninka.

En la población se encuentra el Albergue Humboldt, fundado por el ingeniero y aventurero navarro Jesús López de Dicastillo.