La instalación es más recordada en los cómics por "La Saga Proyecto Pegaso" impresa en Marvel Two-in-One #53-#58 (más tarde recogido como un tomo del mismo título, coescrito por Macchio y Mark Gruenwald con dibujos de John Byrne y George Pérez).
Hubo un tiempo en que también sirvió como un hogar temporal para el Escuadrón Supremo cuando fueron exiliados de su propio universo.
Un científico bribón del Proyecto Pegaso probó varias fuentes de energía en sí mismo.
En Ultimate Origins, Proyecto Pegaso resulta ser un almacén emitido por el gobierno para objetos con orígenes misteriosos y, por lo general, de valor destructivo masivo.
[24] En este universo, el Dr. James Power trabajó para el Proyecto Pegaso siendo contratado para construir un arma de increíble poder.