Siendo la tercera vez consecutiva que el Guadalajara conquistaba el título, se hizo acreedor de la Copa Challenger.

Los catorce participantes disputan el campeonato bajo un sistema de liga, es decir, todos contra todos a visita recíproca; con un criterio de puntuación que otorga dos unidades por victoria, una por empate y cero por derrota.

[1]​ En la temporada 1960-1961 jugaron 14 equipos que se distribuían de la siguiente forma:

Fuente: RSSSFEl Club Celaya, que había ascendido en la temporada 1957-58, desciende siendo este su primer y único descenso a la segunda división, pues nunca regresó al máximo circuito, en cambio otro equipo de la ciudad con el nombre de Atlético Celaya lograría el ascenso a mediados de los 1990s.

Su lugar sería ocupado por los Pericos del Nacional de Guadalajara que ascendieron a primera división tras coronarse campeón de la segunda división por primera vez en su historia.