La poligalacturonasa es una enzima hidrolasa (EC 3.2.1.15, CAS 9032-75-1 ), endo o exoglucanasa, que inicia el corte hidrolítico por el extremo no reductor del polímero de pectina, su sustrato, especialmente la de bajo metoxilo.
Se encuentra en algunas bacterias, hongos y levaduras, fundamentalmente fitopatógenos, y es de mucha aplicación en la industria del zumo.
La poligalacturonasa se encuentra en los frutos de plantas como el tomate.
Este complejo formado por ambos componentes permite la expresión de diferentes genes de defensa frente a patógenos.
Estas últimas, como bien indica el propio nombre, producen la inhibición parcial de las Poligalacturonasas secretadas por el patógeno y deja de dañar a la célula vegetal a la que infectaba el patógeno.