Después de realizar sus estudios en Douai, se unió al ejército francés cuando tenía dieciséis años y participó en las campañas de 1795 y 1796, luego trabajó como administrador del gobierno estacionados en París.
Este trabajo consiste en diecisiete volúmenes (entre ellos doce firmado por Duponchel), 7600 láminas en color y 500 "tablas" (que aparece bajo el título Iconographie des Chenilles o iconografía de las orugas).
Él era un amigo muy cercano de Pierre François Marie Auguste Dejean, Duméril Auguste y Pierre André Latreille.
Se casó con Marie-Joseph-Désirée Ravet y tuvo dos hijos.
Philogène Auguste está enterrado en el cementerio de Montparnasse.