Hujar se trasladó de su Nueva Jersey natal a Manhattan, donde trabajó para revistas y empresas de publicidad y moda.
Su foto más famosa fue la titulada Candy Darling en su lecho de muerte (Candy Darling on Her Deathbed), en la que retrata a la actriz transexual Candy Darling en una lujosa cama, rodeada de flores.
Esta imagen fue utilizada por el grupo Antony and the Johnsons como ilustración de portada de su álbum I am a bird now.
Hujar fue amante y mentor del artista David Wojnarowicz.
Su obra gráfica está gestionada por la Galería Pace/MacGill de Nueva York.